CIViC數(shù)據(jù)平臺的全稱
CIViC數(shù)據(jù)平臺的全稱是:Clinical Interpretation of Variants in Cancer。翻譯成中文就是癌癥基因序列變化的臨床解釋。CIViC是一個由腫瘤基因解碼專家共同搭建的一個開放的網絡平臺。
為什么要建立CIViC網絡數(shù)據(jù)平臺?
正確醫(yī)學是指根據(jù)每個個體及其疾病的獨特特點,來選擇和設計預防、干預和治療策略。對于癌癥來說,不同的癌癥患者個有不同的腫瘤驅動基因,有不同的突變組合,每一個患者可能因為存在特定的突變,從而對化 療藥物及靶向藥物存在著不同的的反應,從面產生不同的治療效果。由于關于腫瘤的基因解碼研究快速發(fā)展,而基因檢測結果的正確與否、以及如何選擇更更多的基因位點進行檢測需要依賴對各種突變序列的解釋。但是由于研究文獻雜亂而分散,而且研究和分析結果主要存在于各個機構的數(shù)據(jù)庫中,從而浪費大量的人力、物力,做著重復性的工作。建立CIViC平臺的目的,就是集中基因信息解碼生態(tài)圈的資源,共同對癌癥中的基因序列變化進行注釋、討論、和應用。并且通過這個平臺傳播基因對癌癥的發(fā)生、治療的知識。推進正確醫(yī)學的發(fā)展。
如何訪問CIViC網絡數(shù)據(jù)平臺?
截至到2020年2月:CIViC平臺的網址是:https://civicdb.org/about。 大家點擊鏈接即可訪問這一公開網絡資源。
參與CIViC網絡數(shù)據(jù)平臺的都有哪些牛人?
使用CIViC平臺的都有哪些機構?
目前使用CIViC數(shù)據(jù)平臺有有很多全球性的大公司和國際知名研究機構。
- Agilent's Alissa Clinical Informatics Platform
- Biogazelle
- BioGPS
- Cambridgene
- CancerStop Android Application
- CBioPortal
- CIViCmine
- DAPHNI – A platform for precision medicine of multiple myeloma
- Database of Curated Mutations (DoCM)
- ETH Nexus Personalized Health Technologies - Swiss Variant Interpretation Platform for Oncology
- Euformatics OmnomicsNGS
- Gemini
- Gene Cards
- Genoox
- GoldenHelix - VSClinical
- Google BigQuery
- International Cancer Genome Consortium (ICGC) Data Portal
- LifeMap Sciences TGex NGS Analysis & Interpretation Platform
- Medical Genomics Japan Variant Database (MGeND)
- Microsoft Research - Natural Language Processing
- MolecularMatch
- Monarch Initiative (via Wikidata)
- My Variant Info
- Monarch Iniative SEPIO - Scientific Evidence and Provenance Information Ontology
- NDEx - The Network Data Exchange
- OncoMX
- PathOS - Peter MacCallum Cancer Centre
- PDX Finder
- Smart Cancer Navigator
- SoftGenetics - Geneticist Assistant NGS Interpretative Workbench
- SolveBio
- TCGA Next-Gen Clustered Heat Map Compendium
- The Hyve
- UCSC Genome Browser (My Data -> Track Hubs -> Cancer Genomics Tracks)
- Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
- VarSome
- Wikidata
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